Docker安装错误 - 未找到文件

技术标签： Docker.

我正在尝试运行下面的docker命令，但是正在收到未找到错误的文件。我已经验证了本地文件夹 /D/VMs/... 包含适当的文件，那个 adam-submit 命令正常运行。我相信我如何安装本地文件夹的问题 - 我假设它将是在位置 /data 对于Docker机器。对于上下文，我正在遵循教程 http://ampcamp.berkeley.edu/5/exercises/genome-analysis-with-adam.html. 使用Docker图像 https://hub.docker.com/r/heuermh/adam/

Docker运行：

docker run -v '/D/VMs/hs/adam/data:/data' heuermh/adam adam-submit transform '/data/NA12878.sam' '/data/NA12878.adam'

Docker运行＃2：

docker run -v //d/vms/hs/adam/data:/data heuermh/adam adam-submit transform /data/NA12878.sam /data/NA12878.adam

错误：

Exception in thread "main" java.io.FileNotFoundException: Couldn't find any files matching /data/NA12878.sam. If you are trying to glob a directory of Parquet files, you need to glob inside the directory as well (e.g., "glob.me.*.adam/*", instead of "glob.me.*.adam"

看答案

从您列出的目录，看起来您正在为Windows运行Docker。这在VM内部运行，映射到容器中的文件夹映射到该VM。要从父操作系统映射文件夹，它需要首先被共享到默认情况下在C：/用户上启用的VM。

如果您使用的是Docker-Machine，请检查VirtualBox的设置，否则，请检查Docker本身的设置以进行共享文件夹，并将其保留/ D / VM。

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